Hva brukes NCBI BLAST til?
Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finner regioner med lokal likhet mellom protein- eller nukleotidsekvenser. Programmet sammenligner nukleotid- eller proteinsekvenser med sekvens i en database og beregner den statistiske signifikansen av treffene.
Er NCBI BLAST en programvare?
I 1990 ga forskere ved National Center for Biotechnology Information (NCBI) ut en ny programvarepakke for rask sammenligning av DNA og proteinsekvens [15].
Hvordan finner du BLAST?
BLAST -sekvenslikhetssøk
- Velg kategorien 'Blast' på verktøylinjen øverst på siden for å kjøre et sekvenslikhetssøk med Blast -programmet.
- Skriv inn enten en protein- eller nukleotidsekvens eller en UniProt -identifikator i skjemafeltet (Figur 37).
- Klikk på "Run Blast" -knappen.
Hva er NCBI GenBank?
GenBank® er en omfattende database som inneholder offentlig tilgjengelige nukleotidsekvenser for mer enn 300 000 organismer navngitt på slektsnivå eller lavere, først og fremst hentet gjennom innsendinger fra individuelle laboratorier og batchinnleveringer fra storskala sekvenseringprosjekter, inkludert hele genomet hagle ( ...